Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MsraQ9D6Y7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms