Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt34Q9D646 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt34Q9D646 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms