Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D4W2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D4W2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms