Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Syce1Q9D495 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syce1Q9D495 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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