Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stag1Q9D3E6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms