Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fndc8Q9D2H8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms