Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms