Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc47Q9D024 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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