Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ddx28Q9CWT6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ddx28Q9CWT6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ddx28Q9CWT6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ddx28Q9CWT6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ddx28Q9CWT6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ddx28Q9CWT6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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