Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NubplQ9CWD8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms