Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CactinQ9CS00 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CactinQ9CS00 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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