Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
StambpQ9CQ26 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms