Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NsmfQ99NF2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NsmfQ99NF2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms