Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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