Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ms4a6cQ99N08 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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