Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bp5lQ99LH9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms