Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pagr1aQ99L02 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms