Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rab28Q99KL7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rab28Q99KL7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rab28Q99KL7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab28Q99KL7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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