Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms