Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms