Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dok4Q99KE3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms