Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ddb2Q99J79 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ddb2Q99J79 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ddb2Q99J79 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ddb2Q99J79 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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