Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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