Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc8b1Q925Q3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms