Protein–RNA interactions for Protein: Q922U2

Krt5, Keratin, type II cytoskeletal 5, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt5Q922U2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt5Q922U2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms