Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf6Q91YR7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Prpf6Q91YR7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf6Q91YR7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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