Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms