Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms