Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col26a1Q91VF6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col26a1Q91VF6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms