Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Stx18Q8VDS8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Stx18Q8VDS8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Stx18Q8VDS8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Stx18Q8VDS8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms