Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8VDP2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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