Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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