Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ApobrQ8VBT6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms