Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms