Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc12Q8K5B8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms