Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms