Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms