Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cchcr1Q8K2I2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cchcr1Q8K2I2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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