Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms