Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brd3Q8K2F0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms