Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim68Q8K243 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim68Q8K243 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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