Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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