Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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