Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms