Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pramef8Q8CE24 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pramef8Q8CE24 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef8Q8CE24 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms