Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc63Q8CDV6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms