Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E4f1Q8CCE9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms