Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8C708 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8C708 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8C708 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8C708 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8C708 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8C708 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8C708 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8C708 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms