Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms