Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrd1Q8C0R9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms